BrainTypeIQ 的綜合 IQ 並不是直接顯示 9 個分項的答對題數。系統會先分別計算各個形式與難度不同的分項成績，把原始分數換算成共同尺度，再進行合成。
BrainTypeIQ 分 4 個階段計算分數
從作答到產生結果，會經過以下流程。
| 階段 | 處理方式 | 產生的結果 |
|---|---|---|
| 1. 各分項計分 | 依作答正誤計分，或計算限時內的表現 | 9 個分項的原始分數 |
| 2. 換算分項分數 | 依目前版本的計分設定與年齡資訊換算 | 換算為共同尺度的 9 個分項分數 |
| 3. 計算合成分數 | 組合各分項分數 | 5 個認知領域、GAI/CPI、綜合 IQ |
| 4. 計算腦型 | 依認知分數的組合進行分類 | 9 種類型與 27 種認知剖面 |
9 個分項的計分方式
詞彙、推理、視空間處理與記憶相關的 8 個分項，會依答對題數計算原始分數。測量處理速度的符號搜尋，則會把限時內正確處理的數量與錯誤反映在計分中。
每個分項的題數、難度與作答形式不同，因此即使原始分數相同，意義也不一定相同。原始分數必須先對照各分項的比較基準，才能換算為可跨分項比較的分數。
9 個分項的內容及其所屬的 5 個認知領域，可參考 9 個分項與 5 個認知領域的測量設計。
日文版依比較基準與年齡建立分項分數
日文版以分析條件一致的 841 名首次完成者為基礎，建立各分項的原始分數分布。系統會確認受測者的原始分數落在分布中的哪個位置，再將 9 個分項換算為共同尺度。
接著，系統會將年齡與認知表現的關係納入分項分數。如此一來，表現較容易隨年齡變化的分項，也能在相同年齡條件下比較。
841 人的篩選條件、年齡資訊的處理方式與比較基準的驗證方法，公開於 BrainTypeIQ 日文版的常模建立。台灣版目前採用以日文版為基礎調整的暫定計分，並持續累積資料。
從 9 個分項計算 5 個認知領域、GAI/CPI 與綜合 IQ
換算為共同尺度的分項分數，會用來計算以下結果。
| 結果 | 計算時使用的分項 |
|---|---|
| 5 個認知領域 | 對應 Gc、Gf、Gv、Gwm、Gs 的分項 |
| GAI | 對應 Gc、Gf、Gv 的分項 |
| CPI | 對應 Gwm、Gs 的分項 |
| 綜合 IQ | 全部 9 個分項 |
綜合 IQ 呈現 9 個分項的整體水準，5 個認知領域呈現不同能力的分數組合。GAI 與 CPI分別整合語文理解、推理、視空間處理，以及工作記憶、處理速度。綜合 IQ 與 5 個認知領域並不是由不同測驗產生，而是將同一組 9 個分項分數，分別整合成整體與能力別結果。
由多個分項組成的分數有多穩定，可參考合成分數的信度與測量誤差。腦型分類也不是由另一份問卷決定，而是根據前面算出的認知分數組合而定。各項結果的意義，整理在 BrainTypeIQ 報告閱讀方式。