BrainTypeIQ 的綜合 IQ 並非直接顯示 9 個分項的答對題數。系統會分別計算形式和難度不同的分項，先把原始分數換算至共同尺度，再組成各項結果。
BrainTypeIQ 分四個階段計算分數
從作答到得出結果，會經過以下流程。
| 階段 | 處理方式 | 結果 |
|---|---|---|
| 1. 計算各分項 | 按答案正誤或限時內的表現計分 | 9 個分項的原始分數 |
| 2. 換算分項分數 | 按日文版的比較基準和年齡資料換算 | 換算至共同尺度的 9 個分項分數 |
| 3. 計算合成分數 | 組合各分項分數 | 5 項認知範疇、GAI、CPI、綜合 IQ |
| 4. 計算腦型 | 按認知分數的組合分類 | 9 種類型和 27 種認知剖面 |
9 個分項的計分方法
測量詞彙、推理、視空間處理和記憶的 8 個分項，會按答對題數計算原始分數。測量處理速度的符號搜尋，則會把限時內正確處理的數量和錯誤答案反映在計分之中。
由於每個分項的題數、難度和作答方式不同，即使原始分數相同，意義也不一樣。每項原始分數都要先按該分項的比較基準換算，才能成為可在分項之間比較的分數。
9 個分項的內容及其與 5 項認知範疇的對應，可參閱9 個分項與 5 項認知範疇的測量設計。
日文版按比較基準和年齡資料換算分項分數
日文版從分析條件一致的 841 名初次完成者中，建立每個分項的原始分數分布。系統找出受測者的原始分數在該分布中的位置，再把 9 個分項換算至共同尺度。
此外，分項分數亦會反映認知能力與年齡之間的關係。這樣，即使某些分項的表現趨勢較容易隨年齡改變，也能在相同年齡條件下比較。
841 人的篩選條件、年齡資料的處理方式和比較基準的驗證方法，均公開於 BrainTypeIQ 日文版的常模建立。香港版現時採用由日文版數據調整而來的暫時計分方式，並正在收集本地數據。
從 9 個分項計算 5 項認知範疇、GAI、CPI 和綜合 IQ
換算至共同尺度的分項分數，會用來計算以下結果。
| 結果 | 用於計算的分項 |
|---|---|
| 5 項認知範疇 | 對應 Gc、Gf、Gv、Gwm、Gs 的分項 |
| GAI | 對應 Gc、Gf、Gv 的分項 |
| CPI | 對應 Gwm、Gs 的分項 |
| 綜合 IQ | 全部 9 個分項 |
綜合 IQ 顯示 9 個分項的整體水平，5 項認知範疇則呈現各項能力的分數模式。GAI 與 CPI分別整合言語理解、推理和視空間處理，以及工作記憶和處理速度。綜合 IQ 和 5 項認知範疇並非由不同測驗得出，而是把同一組 9 個分項的得分，分別整合為整體和各項能力的結果。
各分項合成後的得分有多穩定，可參閱合成分數的信度與測量誤差。腦型分類也不是由另一份問卷決定，而是根據上述認知分數的組合得出。各項結果的意思可參閱 BrainTypeIQ 報告閱讀指南。